MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter felis ATCC 49179 chromosome

Total Repeats: 32131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014810	GC	3	6	39	44	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014810	AAAC	2	8	58	65	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014810	CGC	2	6	150	155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014810	CTTTT	2	10	189	198	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014810	GC	3	6	219	224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014810	AAC	2	6	383	388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014810	TAG	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014810	T	6	6	578	583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014810	AGT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014810	TC	3	6	690	695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014810	CAAA	2	8	766	773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014810	GTT	2	6	778	783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014810	AC	3	6	822	827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014810	TTG	2	6	871	876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014810	AC	3	6	919	924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014810	CAGG	2	8	958	965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014810	CAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014810	CA	3	6	1066	1071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014810	A	6	6	1132	1137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014810	GC	4	8	1144	1151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014810	GAT	2	6	1208	1213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014810	A	7	7	1224	1230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014810	GA	3	6	1299	1304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014810	A	6	6	1351	1356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014810	AAG	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014810	GTG	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014810	TAG	2	6	1395	1400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014810	AGCA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	25 %	25 %	332309248
29	NC_014810	AGG	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332309248
30	NC_014810	AGAGG	2	10	1505	1514	40 %	0 %	60 %	0 %	332309248
31	NC_014810	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	332309248
32	NC_014810	ACT	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332309248
33	NC_014810	GA	3	6	1614	1619	50 %	0 %	50 %	0 %	332309248
34	NC_014810	TTGC	2	8	1701	1708	0 %	50 %	25 %	25 %	332309248
35	NC_014810	AAC	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332309248
36	NC_014810	AAG	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332309248
37	NC_014810	A	6	6	1869	1874	100 %	0 %	0 %	0 %	332309248
38	NC_014810	GTC	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332309248
39	NC_014810	ACA	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332309248
40	NC_014810	CTA	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332309248
41	NC_014810	TGC	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332309248
42	NC_014810	A	6	6	1991	1996	100 %	0 %	0 %	0 %	332309248
43	NC_014810	GATT	2	8	2079	2086	25 %	50 %	25 %	0 %	332309248
44	NC_014810	AGC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332309248
45	NC_014810	GGC	3	9	2164	2172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332309248
46	NC_014810	GCCTAC	2	12	2183	2194	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332309248
47	NC_014810	ATTT	2	8	2384	2391	25 %	75 %	0 %	0 %	332309248
48	NC_014810	GCA	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332309248
49	NC_014810	TAC	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332309248
50	NC_014810	TATC	2	8	2507	2514	25 %	50 %	0 %	25 %	332309248
51	NC_014810	AGCA	2	8	2518	2525	50 %	0 %	25 %	25 %	332309248
52	NC_014810	A	6	6	2561	2566	100 %	0 %	0 %	0 %	332309248
53	NC_014810	GC	4	8	2567	2574	0 %	0 %	50 %	50 %	332309248
54	NC_014810	GGGA	2	8	2588	2595	25 %	0 %	75 %	0 %	332309248
55	NC_014810	TG	4	8	2601	2608	0 %	50 %	50 %	0 %	332309248
56	NC_014810	GAT	2	6	2621	2626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332309248
57	NC_014810	TGAG	2	8	2632	2639	25 %	25 %	50 %	0 %	332309248
58	NC_014810	GGA	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332309249
59	NC_014810	AG	3	6	2688	2693	50 %	0 %	50 %	0 %	332309249
60	NC_014810	TG	3	6	2738	2743	0 %	50 %	50 %	0 %	332309249
61	NC_014810	CAA	2	6	2805	2810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332309249
62	NC_014810	TGT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332309249
63	NC_014810	TC	3	6	2868	2873	0 %	50 %	0 %	50 %	332309249
64	NC_014810	TCC	2	6	2879	2884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332309249
65	NC_014810	CT	3	6	3014	3019	0 %	50 %	0 %	50 %	332309249
66	NC_014810	CTC	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332309249
67	NC_014810	GCT	2	6	3056	3061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332309249
68	NC_014810	GAT	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332309249
69	NC_014810	TTG	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014810	CAT	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014810	CT	3	6	3389	3394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014810	TTGT	2	8	3465	3472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014810	TTC	2	6	3478	3483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014810	ATTGAG	2	12	3555	3566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014810	ATC	2	6	3669	3674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014810	CCTTG	2	10	3683	3692	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014810	CTC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014810	C	6	6	3850	3855	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_014810	CA	3	6	3890	3895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014810	TGG	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315452432
81	NC_014810	GC	3	6	3939	3944	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
82	NC_014810	A	6	6	3955	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
83	NC_014810	AAC	2	6	4057	4062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452432
84	NC_014810	ACA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452432
85	NC_014810	ATTTA	2	10	4088	4097	40 %	60 %	0 %	0 %	315452432
86	NC_014810	AAG	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452432
87	NC_014810	GCA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315452432
88	NC_014810	G	6	6	4137	4142	0 %	0 %	100 %	0 %	315452432
89	NC_014810	CAT	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452432
90	NC_014810	TAC	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452432
91	NC_014810	TAT	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452432
92	NC_014810	TTAGAA	2	12	4176	4187	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315452432
93	NC_014810	GC	3	6	4210	4215	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
94	NC_014810	A	6	6	4283	4288	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
95	NC_014810	ATG	2	6	4386	4391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452432
96	NC_014810	GC	3	6	4431	4436	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
97	NC_014810	AATT	2	8	4486	4493	50 %	50 %	0 %	0 %	315452432
98	NC_014810	ACTCCA	2	12	4495	4506	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	315452432
99	NC_014810	GC	3	6	4597	4602	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
100	NC_014810	GCGTG	2	10	4639	4648	0 %	20 %	60 %	20 %	315452432
101	NC_014810	GCC	2	6	4663	4668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315452432
102	NC_014810	T	6	6	4689	4694	0 %	100 %	0 %	0 %	315452432
103	NC_014810	ATG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452432
104	NC_014810	A	6	6	4759	4764	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
105	NC_014810	A	6	6	4785	4790	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
106	NC_014810	CAT	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452432
107	NC_014810	AAC	2	6	4890	4895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452432
108	NC_014810	TGA	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452432
109	NC_014810	GC	3	6	4982	4987	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
110	NC_014810	AAC	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452432
111	NC_014810	GC	3	6	5023	5028	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
112	NC_014810	GTGGTT	2	12	5061	5072	0 %	50 %	50 %	0 %	315452432
113	NC_014810	TGA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452432
114	NC_014810	TAA	2	6	5114	5119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315452432
115	NC_014810	ATT	2	6	5200	5205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452432
116	NC_014810	GC	3	6	5263	5268	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
117	NC_014810	AGAA	2	8	5271	5278	75 %	0 %	25 %	0 %	315452432
118	NC_014810	GGTG	2	8	5282	5289	0 %	25 %	75 %	0 %	315452432
119	NC_014810	A	6	6	5316	5321	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
120	NC_014810	A	6	6	5350	5355	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
121	NC_014810	CAAA	2	8	5357	5364	75 %	0 %	0 %	25 %	315452432
122	NC_014810	GGC	2	6	5384	5389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315452432
123	NC_014810	AAGGA	2	10	5473	5482	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014810	GAA	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014810	CT	3	6	5641	5646	0 %	50 %	0 %	50 %	315452433
126	NC_014810	GC	3	6	5659	5664	0 %	0 %	50 %	50 %	315452433
127	NC_014810	CAA	2	6	5670	5675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452433
128	NC_014810	CAGC	2	8	5730	5737	25 %	0 %	25 %	50 %	315452433
129	NC_014810	A	6	6	5741	5746	100 %	0 %	0 %	0 %	315452433
130	NC_014810	CA	3	6	5784	5789	50 %	0 %	0 %	50 %	315452433
131	NC_014810	ATT	2	6	5851	5856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452433
132	NC_014810	GGT	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315452433
133	NC_014810	CCTG	2	8	5882	5889	0 %	25 %	25 %	50 %	315452433
134	NC_014810	TTG	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315452433
135	NC_014810	GCC	2	6	6152	6157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315452433
136	NC_014810	TC	3	6	6262	6267	0 %	50 %	0 %	50 %	315452433
137	NC_014810	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	315452433
138	NC_014810	GC	3	6	6326	6331	0 %	0 %	50 %	50 %	315452433
139	NC_014810	CAA	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452433
140	NC_014810	CGTG	2	8	6361	6368	0 %	25 %	50 %	25 %	315452433
141	NC_014810	GC	4	8	6467	6474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014810	GCAA	2	8	6563	6570	50 %	0 %	25 %	25 %	315452434
143	NC_014810	TATT	2	8	6583	6590	25 %	75 %	0 %	0 %	315452434
144	NC_014810	G	6	6	6634	6639	0 %	0 %	100 %	0 %	315452434
145	NC_014810	CGC	2	6	6645	6650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315452434
146	NC_014810	TTAC	2	8	6684	6691	25 %	50 %	0 %	25 %	315452434
147	NC_014810	T	7	7	6861	6867	0 %	100 %	0 %	0 %	315452435
148	NC_014810	GC	3	6	6871	6876	0 %	0 %	50 %	50 %	315452435
149	NC_014810	GC	3	6	6928	6933	0 %	0 %	50 %	50 %	315452435
150	NC_014810	CTA	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452435
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152	NC_014810	GAT	2	6	7063	7068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452436
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157	NC_014810	A	6	6	7317	7322	100 %	0 %	0 %	0 %	315452437
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160	NC_014810	GGA	2	6	7414	7419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315452437
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162	NC_014810	A	6	6	7461	7466	100 %	0 %	0 %	0 %	315452437
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170	NC_014810	A	6	6	7925	7930	100 %	0 %	0 %	0 %	315452438
171	NC_014810	TTA	2	6	8003	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014810	T	6	6	8044	8049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014810	ACTA	2	8	8752	8759	50 %	25 %	0 %	25 %	315452439
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189	NC_014810	TTAG	2	8	8997	9004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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233	NC_014810	GC	3	6	10873	10878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
234	NC_014810	CTC	2	6	10883	10888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
235	NC_014810	TTA	2	6	10952	10957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452443
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258	NC_014810	GAT	2	6	12050	12055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452444
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265	NC_014810	ATG	2	6	12339	12344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452444
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267	NC_014810	GC	3	6	12437	12442	0 %	0 %	50 %	50 %	315452444
268	NC_014810	AAG	2	6	12675	12680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452444
269	NC_014810	TTGGGG	2	12	12730	12741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014810	T	8	8	12885	12892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014810	A	6	6	12970	12975	100 %	0 %	0 %	0 %	315452445
272	NC_014810	ACAT	3	12	13015	13026	50 %	25 %	0 %	25 %	315452445
273	NC_014810	A	7	7	13040	13046	100 %	0 %	0 %	0 %	315452445
274	NC_014810	AGA	2	6	13108	13113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452446
275	NC_014810	CAA	2	6	13121	13126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452446
276	NC_014810	GC	4	8	13209	13216	0 %	0 %	50 %	50 %	315452446
277	NC_014810	AATCT	3	15	13242	13256	40 %	40 %	0 %	20 %	315452446
278	NC_014810	ACAA	2	8	13290	13297	75 %	0 %	0 %	25 %	315452446
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401	NC_014810	ATGGG	2	10	18701	18710	20 %	20 %	60 %	0 %	332309251
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410	NC_014810	CTT	2	6	19317	19322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_014810	T	6	6	19353	19358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_014810	TAGA	2	8	19436	19443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
413	NC_014810	GTT	2	6	19485	19490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_014810	CTC	2	6	19518	19523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
416	NC_014810	T	7	7	19860	19866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_014810	CTTT	2	8	19881	19888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
418	NC_014810	TC	4	8	19926	19933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
419	NC_014810	GTT	2	6	20005	20010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
420	NC_014810	GTT	2	6	20080	20085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_014810	CTC	3	9	20159	20167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_014810	TAA	2	6	20194	20199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_014810	CT	3	6	20301	20306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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427	NC_014810	TTG	2	6	20514	20519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_014810	CT	3	6	20532	20537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
429	NC_014810	T	6	6	20591	20596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_014810	CTTG	2	8	20640	20647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
431	NC_014810	ATT	2	6	20663	20668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_014810	TAG	2	6	20679	20684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_014810	A	6	6	20708	20713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_014810	A	6	6	21332	21337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_014810	ATA	2	6	21347	21352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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